工程保函是指在工程项目中，为了保证合同履约中的义务，双方达成的一种担保形式。它能够帮助工程项目相关方减少经济风险，提高项目信誉度。然而，在工程保函的运用过程中，也存在着一些问题。
有些企业在运用工程保函时没有遵循相关的规定和流程，导致保函的内容与实际需求不相符。这种情况下，保函无法发挥应有的作用，同时也增加了纠纷发生的可能性。
有时候，工程保函权益人需要对承保的项目进行索赔，但由于保函条款模糊或者索赔程序繁琐等原因，导致索赔难以顺利进行。这给权益人造成了不必要的经济损失和时间成本。
在一些情况下，工程保函的费用较高，尤其是对于一些小微企业来说，这是一个不容忽视的问题。高昂的保函费用对于企业资金的使用和经营发展都带来了压力。
有些企业在选择合作伙伴时没有进行充分的风险评估，导致承保项目存在较大风险。如果发生意外情况，那么保函会承担巨大的责任，给企业带来严重的经济损失。
在工程保函的运用过程中，缺乏相关的监督机制，容易出现虚假索赔、保函不落地等问题。这使得保函的真实性和有效性受到威胁，影响了工程项目的顺利进行。
针对以上问题，相关部门和企业可以采取以下措施：
工程保函在工程项目中的运用有助于提升合同履约的可信度和安全性。然而，存在的问题给相关方带来了一定的困扰。通过合理的政策和制度设计，以及相关各方的共同努力，相信能够解决这些问题，进一步完善工程保函的应用。
