保函手续费是指在建设工程中，甲方通过乙方向银行办理保函的过程中所产生的相关手续费用。保函是一种合同性质的担保方式，常用于确保施工方履行约定的责任，同时也为甲方提供了一定的担保。
保函手续费的计算通常基于一定的比例，比如按照投标金额的百分比收取，或者按照保函金额的百分比收取等。具体计算方式可能根据不同的银行以及项目而有所差异，因此在办理保函时需要与银行进行详细沟通和确认。
保函手续费是否计入建工程费用是一个值得关注的问题。根据我国会计制度的规定，通常将保函手续费视为专门担保费用，应该计入合同履行成本中，在工程造价结算中会作为间接费用进行核算。然而，具体是否计入建工程费用最终还需参照当地政府规定和合同条款。
保函手续费的支付对于建设工程的各方都存在一定的影响。对于甲方来说，需要支付一定的费用作为担保措施，增加了项目的成本压力。对于乙方来说，支付保函手续费可能会直接影响其预算和利润。因此，在项目投标阶段，双方需要充分考虑保函手续费对合作关系和经济效益的影响。
针对保函手续费的高昂成本，一些企业常常通过优化策略来降低费用支出。例如，可以与银行协商提供更多的担保资料，以降低保函风险，从而降低手续费率。此外，乙方还可以与甲方在合同中明确保函手续费由谁承担，并在谈判中争取到更加合理的费用分担方式。
保函手续费作为建设工程中常用的担保形式之一，其计算和计入费用的问题对于项目的推进和双方权益都有重要影响。在办理保函时，甲方和乙方应该根据具体情况选择合适的银行、合理协商费用，并合理规避风险。只有通过科学合理的保函手续费管理，才能最大限度地实现项目目标。
