银行保函作为企业在业务合作中一种常见的担保方式，面临着一些困难问题。首先，银行保函的金额受到限制。根据监管要求，银行对于单个保函的金额都有上限，这对于需要大额担保的企业来说可能会带来一定的困扰。当企业需要提供金额超过上限的保函时，需要寻找其他担保方式或者多家银行进行联合担保。
其次，银行保函的申请手续较为繁琐。企业需要提供大量的文件材料，并经过银行的审核和评估。这样的手续往往需要耗费较长时间，对于急需保函的企业来说可能会有所不便。此外，由于银行对于担保对象的审查要求较高，对于信用记录较差或者规模较小的企业来说，银行保函的申请往往难以通过。
银行保函的费用较高也是一个问题。银行保函需要支付一定的手续费用，同时还需要缴纳一定的保证金。对于负担较重的企业来说，这些额外的费用可能会增加其运营成本。此外，手续费用的多少也与银行的信用评级有关，对于信用评级较低的企业来说，费用更加昂贵。
另外，银行保函的审批时间较长也是一个困难。由于银行需要对企业的情况进行调查和审核，整个过程可能需要数天甚至数周的时间。这对于一些比较紧急的合作项目来说可能会造成时间上的压力。为了避免因审批时间导致合作失败，企业可能需要提前做好充分的准备并尽早进行申请。
最后，银行保函的信任度难以建立。对于一些合作伙伴来说，他们可能对于银行的保函并不太了解，无法判断其真实性和可靠性。在一些特殊情况下，需要提供更高信任度的担保方式，而银行保函可能无法满足这些要求。因此，在一些特殊行业或重要交易中，企业可能需要选择其他更为可靠的担保方式。
