工程保函是一种在工程项目中常见的担保方式，用于保证工程承包商履行合同义务。然而，与其他担保方式相比，工程保函的费用较高，对于中小型企业来说可能会增加不小的负担。
工程保函通常包含各种限制性条款，其中最常见的是保函金额不能超过工程合同价款的一定百分比。这样的限制使得工程承包商在申请工程保函时受到了一定的限制，有时可能难以满足客户或项目业主的需求。
一旦发出，工程保函通常是不可撤销的。这意味着即使在工程项目进行过程中出现了一些变化或风险情况，承包商也无法撤回已经发出的保函。这给承包商带来了一定的风险，可能需要承担额外的责任或付出更多的成本。
工程保函通常需要经过银行的审核才能发放，这可能会增加整个过程的时间和成本。银行审核的要求较为严格，包括对承包商信用状况、抵押品等方面的评估，这对于一些信用较差或缺乏抵押品的企业来说可能会面临更大的困难。
工程保函需要申请人提供一定数额的授信额度作为担保，这将直接影响企业在其他领域获得信用额度的能力。如果企业的信用额度主要用于工程保函，那么在其他领域开展业务时就可能受到限制，从而影响公司的发展。
尽管工程保函是法律约束力的证明文件，但在实际操作中仍然存在一定的法律风险。例如，保函金额是否满足工程项目的要求、保函是否针对正确的受益人等问题都可能引发争议和纠纷，给企业带来不必要的律师费用和时间成本。
