预付款保函和信用证是国际贸易中常见的支付方式，虽然它们都是为了保障买卖双方权益而设立的金融工具，但在实质和使用上存在诸多区别。
首先，预付款保函主要适用于大额交易和非标准化产品，通常由买方向银行开立，并向卖方提供保函作为合同履约的保证。保函金额等于合同价款的一定比例，一般在合同签订后买方需要向银行缴纳相应的保证金。而信用证则适用于各类交易，由买方向银行申请开立，提供给卖方作为支付保证，可以根据实际情况进行调整。
其次，预付款保函的核心目的是确保卖方能够按合同要求履行，如果卖方不能按时发货或未按合同规定提供证明文件，买方可以向银行索赔。而信用证更强调付款责任，即在卖方提供符合信用证规定的单据后，银行有义务支付买方。
此外，预付款保函属于担保性质的文件，其开立和解除都较为简便，买卖双方可以根据需求灵活操作。而信用证则严格遵循国际规则和相关条款，一旦开立即具有法律约束力，并且需要按程序处理变更和撤销。
最后，预付款保函通常在交易前期使用，以消除买方对卖方的担忧，保障资金安全。相比之下，信用证更多地应用于交易过程中的实际支付环节，更侧重于资金流转的顺畅与合规。
