银行保函和LC（信用证）是国际贸易中常用的金融工具，它们在实际操作上有一些区别。首先，银行保函是银行以保证人身份向受益人发出的一种书面承诺，保证承担一定义务的方式。而LC是由进口方银行代替进口商在进口交易中向发货方或者卖方的银行发出的一种书面通知，通知发货时付款给卖方。
其次，银行保函的目的是确保收款方能够按照合同的约定履行义务，当保函开立后，如果收款方未能按照合同履行义务，受款方可以向保函的开立行索赔。而LC则是为了确保支付方能够按照合同履行付款义务，如果支付方未能履行付款义务，发货方可以向LC的开证银行索赔。
第三，银行保函的责任与涉及交易的金额大小无关，即使是小额交易也可以使用保函。然而，LC的金额通常较大，因此对于小额交易来说，使用LC可能过于繁琐。
此外，银行保函和LC的法律性质也有所不同。银行保函是一种独立的承诺，与主合同无关，因此受益人可以直接向保函的开立行索赔。而LC与主合同有着密切的联系，双方必须按照主合同的要求进行交付和支付，否则可能引发法律纠纷。
最后，银行保函和LC在实际操作中的手续相对复杂。银行保函通常需要经过几个步骤，包括申请、审查、签发等，整个流程可能较为繁琐。而LC的操作相对简单一些，根据国际惯例，大都采用统一的规则，如国际商会颁布的《国际信用证统一惯例》（UCP）。
总的来说，银行保函和LC在实际操作上存在一些区别。使用时需要根据具体情况选择适合的金融工具，以确保交易安全顺利进行。
