履约保函金是指在合同签订过程中，为保证合同的完整履行和防止违约风险，约定一方向另一方提供的一种担保方式。在一方违约时，可以通过扣除履约保函金来补偿受损一方。
首先，需要明确合同中关于违约责任和履约保函金的规定。一般而言，合同会明确违约方需要支付的违约金金额，以及履约保函金的用途和扣除方式。
其次，如何扣除履约保函金需要遵守法律法规和合同约定。通常情况下，受损方应当在违约发生后尽快向保函发出方提出书面通知，并提供相应的证据和材料。
合同约定了违约方需要支付的违约金金额，但并未明确履约保函金的扣除额度。在没有特别约定的情况下，通常会根据违约方的违约程度和给受损方带来的损失情况进行考量。
双方可以进行协商或者通过仲裁等途径确定扣除额度。如果达不成一致，可能需要通过法律诉讼解决纠纷。
当违约方支付了相应的履约保函金后，保函的执行机构会将款项划拨给受损方。此时，保函金的用途就实现了。如果合同中约定了保函金的退还条件，则在合同履行完毕后，可以申请退还剩余的履约保函金。
避免违约是最好的方式，以下措施可帮助降低违约风险：
1. 建立完善的合同审查机制，确保合同的清晰明了；
2. 确保双方具备履行合同的能力和资质；
3. 加强合同履行过程的监控和管理；
4. 引入第三方担保机构，提供更强有力的担保方式。
违约怎么扣除履约保函金是一个涉及法律、合同等方面的复杂问题，需要在明确合同约定的基础上依法操作。双方在签订合同时，需认真审查并清楚约定了各项责任和权益，以避免潜在纠纷的发生。
