履约保函和预付款保函都是商业合同中常见的担保方式，用于确保合同各方能够按照约定履行自己的义务。履约保函主要用于确保承包商或供应商能够按时交付商品或完成工程，而预付款保函则用于确保付款方按照合同约定支付预付款。
履约保函在合同中的作用主要是为了减少购买方或委托方因为承包商或供应商无法按时履约而产生的损失。履约保函的特点是保证金的形式，保函金额通常与合同价款相关，并且在合同期限内有效。
预付款保函在合同中的作用是确保付款方按照合同约定支付预付款给承包商或供应商。预付款保函的特点是，保函金额通常与预付款金额相等，有效期限包括预付款支付期限及退还期限。
履约保函和预付款保函在一些方面存在差异。首先，在用途上，履约保函主要用于确保交货或完成工程，而预付款保函主要用于确保付款方按时支付预付款。其次，在期限上，履约保函通常在合同履行期内有效，而预付款保函的有效期限包括预付款支付期限及退还期限。
在商业合同中应根据具体情况选择使用履约保函或预付款保函。如果是为了确保商品或工程能够按时交付，则可选择履约保函。如果是为了确保付款方按时支付预付款，则可选择预付款保函。
履约保函和预付款保函作为商业合同中的担保方式，为合同各方提供了保障。在使用履约保函或预付款保函时，需仔细阅读保函条款并遵守相关规定，以免产生纠纷。
