工程履约保函是指发包人（业主）在承包人（承包商）中标后，要求其开具的一种担保文件，用来保证承包人能够按照合同要求完成工程，并对可能出现的违约行为承担相应责任。然而，关于工程履约保函费用由谁出，却一直存在争议。
首先，有些业主或建设单位认为，工程履约保函是承包人履行合同的一部分，应由承包人自己承担费用，并且工程履约保函的费用也不菲，如果由业主或建设单位承担，就增加了他们的成本负担。
另一方面，也有不少承包商认为，工程履约保函是由业主或建设单位要求提供的，本质上是为了保障业主或建设单位利益的一项风险控制措施，因此费用应由业主或建设单位承担。
事实上，在具体的合同中，工程履约保函费用是否由业主或建设单位承担、是否与工程合同款项挂钩、费用比例等问题都可以通过双方协商来达成一致。这也意味着在签署合同时，双方要明确规定好工程履约保函费用的承担方式。
此外，我国《合同法》第41条规定：“当事人对合同的内容有约定的，适用其约定。”这就意味着，双方在签署合同时对工程履约保函费用所做出的约定，将成为约束双方行为的依据。
除了法律规定外，双方在决定工程履约保函费用责任时，也需要综合考虑业务关系和市场惯例。如果承包商在竞标过程中费用已进行了测算并计入报价中，那么可能由业主或建设单位承担可能更为合理。反之，如果业主或建设单位指定了具体的银行或保险机构提供保函，并由承包商去开立保函，则费用可能由承包商自行承担。
总的来说，工程履约保函费用的承担既可以根据双方协商和约定来确定，也可以根据司法解释和相关规定进行判断。在签订合同时，双方应明确约定费用的承担方式以避免日后产生纠纷。
