履约保函是合同中常见的一种保证方式，由甲方（发生违约行为的一方）向乙方提供的担保函。履约保函是确保甲方能够按照合同约定完成相关义务，并承担相应的责任。
当甲方存在违反合同约定的行为时，即甲方发生违约。违约行为可以包括无法履行合同、超过约定期限未履行合同、提供不符合质量要求的产品或服务等。
当甲方发生违约时，乙方可根据合同约定采取相应的补救措施。补救措施可以包括解除合同、要求继续履行合同、要求赔偿损失等。
履约保函在合同中的作用主要体现在对乙方的保障上。当甲方发生违约时，乙方可以依据履约保函向保函发出的银行索赔，以获得违约金等相应的赔偿。
在一般情况下，当甲方违约时，乙方有权利向保函发出银行索赔，并获得相应的赔偿。因此，甲方违约可以扣除履约保函。
然而，要注意的是，履约保函并非无条件可扣除的。在合同中可能存在一些限制条件，例如合同约定保函只能在特定情况下扣除、保函金额有上限等。
如果甲方与乙方对于是否可以扣除履约保函等问题产生争议，在无法协商解决的情况下，双方可以通过法律途径，寻求司法机构的介入并进行争议解决。
