提交工程履约保函需要支付一定的费用，包括保险费、手续费等。对于一些项目来说，这个额外的成本可能会增加企业的负担，因此选择不提交工程履约保函。
在一些情况下，承包方可能对甲方的信誉产生怀疑，认为甲方无法按照合同要求履行其责任。这时，承包方可能不愿意提交工程履约保函，以保留足够的应对措施。
有时，承包方可能已与甲方建立了良好的合作关系，彼此之间有着相互信任和了解。在这种情况下，双方可以通过其他适当的安排来取代工程履约保函，如提供抵押物或者签署相关的合作协议。
一些承包方担心提交工程履约保函会对其信用记录造成不利影响。保函的提交可能会被认为是企业信誉不佳的体现，对未来的合作机会产生负面影响。
大型工程项目往往在施工过程中会发生一些变更，这可能导致承包方需要修改工程履约保函内容。然而，由于保函的性质使其难以修改，承包方可能选择不提交工程履约保函，以避免后续风险。
除了工程履约保函，还存在其他形式的担保方式，如银行承兑汇票、保证金等。在某些情况下，这些担保方式可能更适合承包方的需求，因此放弃提交工程履约保函。
有些项目可能要求承包方从保险公司处获得工程履约保函，并经过相关政府部门的审批才能使用。这个流程可能会非常繁琐和耗时，给项目进展带来不必要的延迟。
